A ver, son 2 cosas diferentes:
Cada sub tiene un control propio en el que puedes regular el punto en el deseas que deje sonar. De esa forma intentas una buena integración con los altavoces forma manual (algunos sub tienen su propio sistema de eq, pero no suelen establecer el punto ideal de corte)
Por otra parte, puedes dejar que sea el receptor el que haga corte (también de forma manual o tras pasar un ecualizador). En ese caso los puntos de corte del sub se deben poner lo más alto posible ( mejor 200 hz que 100hz, p ej), o incluso desactivar el control de corte del sub si deja.
De esta forma te aseguras que sólo hay un proceso actuando sobre el punto de corte.