Cual es la mejor forma de organizar las carpetas de peliculas en un ASUS HD2

Hola, he pedido este multimedia con 2TB, y actualmente tengo en un HTPC ordenados los archivos por carpetas con las letras del abecedario, y no se si es efectivo tenerlo así, o si el reproductor indexea las pelis las metas como las metas.
Reorganizarlas por temática supongo que seria lo suyo, pero si lo tengo que hacer una a una necesitaria otra vida mas, cual es la manera mejor para ir haciendo algo mientras me llega?

Gracias.

joer la crisis aprieta, antiguamente en este foro habia movimiento....

de tantas respuestas no se cual elegir...:descolocao