Puesto que la nueva pelicula de Alien sera una secuela directa de Alien 2 todos nos preguntamos como se las arreglaran para obviar Alien 3 y 4, pues bien, yo creo que no es ni necesario obviar dichas entregas y todo se puede solucionar de la siguiente manera:

Tras Alien 2 y despues de 30 años Ripley, Hicks y Newt son rescatados por un equipo de rescate todos ellos vivos (interpretados los 3 a poder ser por los mismos actores), a partir de aqui volveriamos a meter a los Aliens otra vez de alguna manera en el argumento teniendo en cuenta a estos 3 personajes y a uno nuevo con el cual Ripley se reencontraría, su hija Amanda Ripley ..., a mitad de pelicula Ripley se enteraría de que entre los sucesos de Alien 1 y Alien 2 la compañía obtuvo muestras de su ADN y que tras los sucesos de Alien 2 la dieron por muerta al no encontrarla, por lo tanto utilizaron dichas muestras de ADN para clonarla, y la compañía para que todo pareciera mas real consiguieron muestras de video de como Ripley, Hicks y Newt escapaban del planeta vivos, por lo tanto al clon de Ripley le implantaron una especie de ultimos recuerdos para que no sepa que es un clon de la Ripley original y también clonaron a Hicks y Newt pero al no ser necesarios pusieron clones muertos de ambos en las capsulas haciendole creer al clon de Ripley que ambos habían muerto durante el viaje, al mismo tiempo implantaron al clon de Ripley una reina alien y para que nadie se enterada de nada hicieron que la nave se estrellara en el lugar mas perdido y olvidado de la galaxia para asi dar tiempo a la clon de Ripley a parir al Alien sin que se conociera nada de lo sucedido, y es aqui dónde comenzarían los echos sucedidos en Alien 3, con una clon de Ripley y con unos recuerdos implantados, por tanto de esa manera tanto en Alien 3 como en Alien 4 las dos Ripleys fueron clones.

De esta manera la saga Alien seguiria contando con dos lineas argumentales, la de la Ripley original detras de Alien 2 y la Ripley medio Alien de Alien 4, para de esta manera seguir haciendo peliculas de ambas lineas temporales según convenga.