hombre, cualquiera de las 2 opcione es buena, cada uno la que mas le conviene.
Hay gente que prefiere tener un "todo en uno" para no tener que andar con aparatos, cables y enchufes varios y otra gente prefiere dejar el mediacenter quieto junto a la tv y usar un disco externo mas pequeño y portatil para mover los archivos de aqui para alla, dado que los multimedia no están pensados para moverlos mucho de sitio.
Si prefieres menos aparatos y cables, un hdd multimedia es una mejor opcion.
Si prefieres movilidad el hdd independiente.
Por lo que es a calidad, depende del aparato en si, mas que de un sistema u otro, es decir que los dos sistemas pueden funcionar y verse bien.... o mal si te salen rana.
Si te interesa el formato rmvb (que por aca es poco habitual) fijate que en las caracteristicas que pueda con él y ya está.