Al introducir el cd te preguntará si quieres actualizar de W2K a W XP. Si te interesa conservar configuraciones y datos pues actualizas y en paz, todo desde Windows.
Si de veras quieres borrar todo pues mete el cd y reinicia, debería preguntarte que quieres hacer, le dices formatear e instalar y tampoco deberías tener mayor problema.

Suerte!