Deberías especificar que tipo de subtítulos. ¿Los srt. de toda la vida o los PGS que se extraen directamente del Blu-Ray?
Si son estos últimos olvídate, ningun reproductor BD los reproduce en contenedor MKV. Sin son los srt. corrientes debería reproducirlos.
Si buscas algo económico debería servirte con éste.
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Y si lo quieres con 3D tienes que ir a por su hermano mayor.
http://www.amazon.es/Samsung-BD-F550...msung+bd-f5100
Eso sí, verifica primero que tipo de subtítulos son los que vienen en esos MKV que tienes. Yo no tengo ninguno de los dos reproductores mencionados, pero en este mismo foro tienen sus respectivos hilos propios donde podrás preguntar y seguramente compañeros que lo tengan responderán a tus preguntas.
Suerte.