Configuración Samsung C8000 3D y Blu-Ray Samsung 5900 3D

Hola

Pues tengo estas dos cosillas y no tengo ni pajorela idea de configurarlo, lo que sí que noto son los fallos.

La tele la tengo configurado como viene más o menos por defecto, lo único que he modificado es el motion plus que lo tengo en suave y poco más, pero hay mil configuraciones que no te explica ni el manual ni para qué son, solo te dice que lo tiene y punto.
El tema que más me preocupa es el 3D, yo sinceramente algunas cosas las veo que te cagas y otras como que no hay 3D, me imagino que no es lo mismo ver una peli 3D por .mkv a verla directamente de un blu-ray 3D,¿es así no?
El tema es que el 3D veo que a veces se ven como que la imagen esta doblada, cero que se llama este fallo “clouding” y en algunos casos se pierde el efecto 3D, creo que será un tema de configuración ya que veo por ejemplo la peli monstruos vs alienígenas en una tienda en una c7000 y veo una profundidad de la leche mientras que en la mía no la aprecio tanto, se supone que tendría que verse como poco igual al ser un modelo superior, ¿NO?
La configuración de blu-ray con la tele la tengo por defecto como la pone con la movida esa de Samsung que se supone que te pone la mejor configuración posible, pero me da a mí que no es la mejor.
¿Alguien que tengo esto o parecido me podría decir como configurar los parámetros de las dos cosas para sacarlo el mayor partido?
Otra duda, tengo un HDD externo que antes conectaba directamente a la tv pero me dijeron que seguramente mejoraría la calidad sobre todo en contenido 3D si lo enchufaba al blu-ray ya que tiene mejor decodificador 3D,¿Creeis que es mejor enchufarlo a la Tv o al Blu-ray?
Por cierto lo tengo conectado con un cable HDMI 1.4

Perdón por el tostón y gracias.