Hola. Intenta conectar el disco a tu pc, y desde allí formatearlo a ntfs desde administración de discos de Windows.

Si tu sistema operativo no reconoce la unidad, podrías intentar iniciar tu equipo con un live cd de una distribución linux como partedmagic:

http://partedmagic.com/doku.php?id=downloads

Es decir, descargarías el live cd, lo quemarías en un cd en blanco e iniciarías el equipo desde la unidad dvd (cambiando en la bíos la opción boot para que leyera en primer lugar el dvd en vez de el disco duro, si es que no estuviera así)

Desde este live cd podrías dar formato y particionar sin problemas tu disco.

Salu2.