Hombre, considerando que el reloj de un ordenador es una aplicación que funciona con el equipo apagado, éste (el reloj) podría tener algo parecido a una alarma o similar que, convenientemente programada, actuara en el sistema de encendido del pc
El reloj es un reloj, como el que llevas en la muñeca, no una aplicacion. Una aplicacion es un codigo alojado en memoria que se ejecuta en el procesador.
Puede que algun ordenador tenga algun metodo de wake up automatico, pero al que no lo tenga no vas poder instalarle nada que lo haga.

Saludos