Yo no he escuchado un sistema atmos pero supuestamente es tecnología punta en el mundo del audio, con lo cual así a priori si me dieran a escoger, escogería 5.1.2.
Esos dos canales de "objetos" deben estar ubicados apropiadamente para obtener un atmos adecuado. Yo soy fan de poner los altavoces donde deben estar (en este caso en el techo). Cualquiera de los altavoces que mencionas puede ubicarse en el techo.
Los Onkyo que mencionas NO están hechos para ponerlos en el techo exactamente, sino para optimizar las refracciones del sonido y hacer que la onda "te venga" como del techo, poniéndolo encima de los frontales. Esto es una emulación y que me perdonen, debo ser muy purista, pero mi opinión es que el sonido es más direccional de lo que se asume al hacer esto. Yo definitivamente si me montara un atmos pondría altavoces en el techo.
Los BX2 si los quieres montar como atmos sí que tendrás que ponerlos en el techo. No sirve lo de ponerlos contra la pared porque no están optimizados para esas funciones.
O sea que los Onkyo es para hacer un atmos de estos emulado, los BX2 te servirían para collarlos en el techo y obtener un atmos más direccional.
Espero haber resuelto algunas dudas y también espera a las respuestas de mis compis, que saben más.