La mayoria de mediacenters no son capaces de alimentar un HDD por el puerto USB, aunque sea de 2,5", creeme, lo se por experiencia, que casi me cargo uno de 500GB, al final solo me toco particionarlo y formatearlo de nuevo, asi que diferencia hay, otra cosa que tengas tu uno de 3,5" SATA, y compres el mediacenter sin el para poner el tuyo, pero en este caso te va tocar formatearlo con el menu del aparato para que te funcione correctamente (con lo perdera lo que tengas en el)

Para leer sticks USB, no hay problemas.

Si tienes uno externo de 3,5", el problema es que necesitas tener conectadas dos fuentes de alimentacion, una par el HDD externo y otra para el mediacenter.