Me parece muy raro q sin utilizar Avisynth t pegue esos tirones q dices, mas teniendo una maquina moderna..
Hay algo por ahi raro que t esta comiendo recursos.
Reinicia el ordenador y nada mas arrancar Windows, pulsa Ctrl + Mayus. + Esc y observa el uso de la CPU.
Deberia de estar al 1 o 2 % como mucho.


Un saludo