Hombre, con el VLC lo dificil no es que se vean los subtitulos, que son un archivo externo que se puede cargar mientras ves la película, sino sincronizarlos... pero con un poco de maña con el Subtitle Workshop, no tienes por qué tener muchos problemas. El método más simple es pulsar Ctrl+B, y sincronizar la primera y la última línea. Normalmente con eso basta