Gracias por responder. Pues finalmente lo acabo de resolver con una solución aún más casera . Como estamos hablando de solo medio millón de registros, los he importado en Access, me he cargado los duplicados con una consulta y lo he vuelto a exportar a un fichero de texto plano. Finalmente he hecho el "load from" y como ahora no hay duplicados en la clave, pues lo ha importado sin problemas.

De todas formas esto de que cada DBMS tenga su propio SQL modificado es una tocada de cojones de cuidado. En fin, muchas gracias por vuestra ayuda