No soy fan de recomendar porque creo que cada uno es el único que realmente sabe qué quiere y para qué lo va a usar, así que igual no te sirve de mucho mi respuesta.

Entre las opciones que citas:

1) La ventaja que les veo a la Raspberry Pi (y similares como las odroid, etc...) es, además del precio, si la vas a usar para algo personalizado y único, quieres aprender a programar el hardware o te gusta la electrónica. Es decir, te lo recomendaría si, por ejemplo, quisieras meter la placa en la carcasa de tu Woxter y hacer que la Pi te controlara el display del I-Cube además de reproducirte los archivos. Así tendrías bastante diversión (tiempo entretenido entre el montaje y el aprendizaje) por muy poquito dinero.

Al menos yo no me compraría la Pi sólo para meterla en su caja oficial y usarla de mediacenter, salvo que fuera lo único que me pudiera permitir con mi presupuesto. No porque no pueda servir para ello sino porque me parecería estar malgastando las otras posibilidades que te ofrece una tarjeta de este tipo.

2) Te aconsejaría un reproductor o Mediacenter tradicional con Android o Linux en el caso de que dicho reproductor incluyera ABSOLUTAMENTE TODO lo que buscas en un aparato de su clase o fuera lo suficientemente ABIERTO permitiéndote modificar el firmware (ser root en Android y/o añadir drivers/programas que te pudieran interesar) y tuviera una comunidad lo suficientemente amplia y con gente preparada para hacer las modificaciones que pudieras necesitar (suponiendo que tú no fueras capaz de realizarlas por ti mismo).

El peligro de estos equipos es que a veces prometen más de lo que finalmente pueden ofrecer (futuras mejoras en el firmware que nunca llegan o soporte de nuevos codecs que, en el mejor de los casos, llamaríamos incompleto o quizá a costa de convertir el reproductor en una tostadora por el calor que desprende el procesador).

3) Las ventajas de los miniPC basados en la plataforma x86 es que les puedes instalar prácticamente cualquier SO y/o programa que uses en tu PC. Las desventajas serán que el precio y el consumo energético seguramente subirán respecto a otras opciones. Pero a veces hay gente que quiere todo lo que ofrece un PC y se empeña en encontrarlo en un reproductor que es imposible que se lo ofrezca.

Saludos.