Respuesta: [BD] Lector LG BD550
Efectivamente, usando la última versión del mkvtoolnix (4.5.0) y marcando esa casilla, funciona también perfectamente. En resumen, los .mkv que no llegan a cargar, pasándolos por el mkvtoolnix otra vez con la casilla de marras marcada, funcionan bien.
En cuanto...