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Pues respecto al puerto serie creo que tengo el conector localizado (4 pines, 1 es 0V y los otros dan alrededor de 3V, tensión TTL de los puertos serie, probablemente una sea la tensión de referencia, y los otros dos sean TX y RX conectado a un pull-up). Me he preparado un cable en el trabajo para hacer pruebas, pero... no tengo puerto serie en el PC (que gañan que soy!). Mañana pillaré un conversor serie-usb en alguna tienda, y en el peor de los casos, me llevo el cubo al curro el viernes y le pìncho un osciloscopio a ver que línea es tx y a que velocidad está configurada.
La configuración que probé y funcionó con el HMR-600W es:

Speed: 115200
Data bists: 8
Parity: None
Flow Control: None

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¿Sysctl? He revisado la página del manual por si estaba demasiado oxidado, pero no, sysctl vale para alterar valores en /proc/sys/* y no encuentro nada relacionado con el timeout de sata en él.
Fallo mío. Me sonaba haber visto algo parecido, así que busqué en Google sysctl /sys/block y encontré algunos resultados, así que lo puse por si acaso. Si te lo puse como interrogación es porque tampoco estaba muy seguro de que funcionase. Aunque "parece" que en algunos sistemas el sysctl también puede modificar valores de /sys (uno de los resultados de Google: https://forum.openwrt.org/viewtopic.php?id=28574)

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- Comentar la ejecución del DvdPlayer para conectarme vía telnet antes de que "la monte parda", y analizarlo, pero no tengo claro porqué telnet no está disponible entonces (parece por el pid que tiene que lo lanza el propio DvdPlayer al final del todo).
Lo que no está disponible es la red ya que es tarea de DvdPlayer leer la configuración necesaria e iniciarla. Si no ejecutas DvdPlayer debes levantar la red por tu cuenta. telnetd se ejecuta por inetd ( ver /etc/init.d/S50inetd y /etc/inetd.conf )

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- Intentar usar los modulos sata_mars y libata del HMR-600 (a ver si funcionasen tal cual). Pero tampoco creo que esto lo solucione, ya que por lo que he leido no establecen el valor del timeout, pero si tampoco lo hace udevd... ¿quíen demonios establece este valor en el cubo?
Estos reproductores me temo que no conocen udevd, en su lugar (supongo) tienes /sbin/hotplug. Aunque, sinceramente, tampoco es que tenga una respuesta a esa pregunta.

Saludos.