Buenas:

Yo utilizo:

Advanced uninstaller (Desinstala programas, limpia registros, temporales de internet, cuando lo ejecutas avisa de los últimos programas que se han instalados, etc...)

Registry mecanic (por el nombre ya te imaginarás de qué va)

Reg supreme (el mejor de los tres, pero con ojito con algunas opciones)

Bueno de todas formas, el tema del registro de güindous es como para mírameynometoques.

Saludos.

PD: Considerando las meteduras de dedos en teclas y programas varios, no estaría de más que hicieras una imagen del disco con norton ghost (por ejemplo). Cuando tengas problemas Format c: y restauras la imagen en 20 minutitos con todos los programas y funcionando todo correctamente.

PD2: Para no liarse con el tema de datos S.O., recomendación Particionar el disco (una para el S.O. y otra para los datos) o dos discos duros (que están baratos de coj )

Edito para decir que no son gratis