lamoda no te puedo ayudar ya que si me bajo un bluray full lo dejo tal y como esta y no le quito ni dejo nada; seguro que el fallo esta en las opciones del tsmuxer, pero no te puedo asegurar ( pasate por antiscreeners y pregunta ).

Respecto al jukebox, en la ruta de arriba pongo la direccion donde estan los mkv, en mi caso F:/pelishd, y en la ruta de abajo he probado con todas las opciones, incluso en mypc para que no se haga la picha un lio y falla con todas... la verdad es que estoy negroooooorrrrr. OS digo los pasos por si meto la pata:
1- bajo el fichero
2- descomprimo en carpeta
3- ejecuto el gui, sin borrar ni renombrar nada del contenido de la carpeta
4- pongo el directorio donde estan las pelis
5- pongo mypc para que el directorio sea el mismo f:/pelishd
6- ejecuto, y

FALLO QUE TE CRIO..