Con respecto a los subtítulos que vienen en los discos físicos, son imágenes y cuando se pasan a un mkv el pana no es capaz de mostrarlos. Lo que hay que hacer es extraerlos, pasarles un OCR y convertirlos en texto. Una vez convertidos en texto, se pueden incluir en el mkv y ya se ven perfectamente. Cuando me he digitalizado mis propios discos, he tenido que hacerlo. Es un poco pesado pero queda bien.

Cuando la gente se baja un mkv unos vienen con los subs pasados a texto y otros no, por eso algunos se ven y otros no.