Yo en mi caso para q no se caliente mas de lo q toca, tengo la caja abierta sin tapas. Le entra mas mierda, pero no sube tanto la temperatura y el flujo del aire es infinito. Con limpiarlo de tanto en tanto ya tira.
En ese tiempo me han petado 2 discos duros (samsung e IBM) . Tambien estla con la caja habierta y bien fresquito todo.
Error habitual. Las cajas están diseñadas para generar una corriente de aire que permite enfriar eficientemente los componentes, no solo aquellos que llevan ventilador como pueden ser la tarjeta gráfica o la propia CPU. El aire debe de entrar por el frontal y salir por la parte trasera. Así, además, se evita que el calor extraido por los ventiladores internos (de nuevo CPU o gráfica) vuelva a ser aspirado por los mismos, reduciendo la capacidad de enfriamiento.

Ante la duda, tomad mediciones de temperatura con y sin tapas.