El contenedor MOV y MSTS pueden albergar mucho codec diferentes, por ejemplo para MOV hay 6 o 7 codec posibles, epro lo habitual en MAC es usar "M-JPEG" y éste códec casi nop es compatible con ningún reproductor, pero los MOV "normales" en HD son en codec h264 casi como los MP4 de los trailers de la web de MAC, éstos si son compatibles.
El tema de los M2TS es mucho más fácil, sólo soportan: H264, MPEG2 Y VC1. Para AVCHD se usa H264, epro algunas cámaras no usan un estandar de codificación usan el perfil "BASELINE" de H264 y no es compatible con nada...