Desde un PC y desde el navegador web, escribe http://ip_de_tu_cubo:1024 , ve al icono de torrents, y comprueba si hay descargas.
Si no te deja acceder a la pagina de gestion de transmission, ve al icono de informacion de sistema y copmprueba que transmission esta funcionando. Si no lo esta desde esa misma pestaña, puedes activarlo.
Si tras activarlo se vuelve a desactivar solo, es que tienes demasiados servicios en marcha y el cubo va apagando los que estime oportunos, casi siempre empezando por transmission. Comprueba que servicios tiene activados y no estas usando. por ejemplo activar el servidor UPnP si no se esta usando, es mala idea, ya que consume muchos recursos, el servidor UPnP junto con transmission es practicamente inusable.
Yo por ejemplo ahora mismo solo tengo activado, SAMBA y TELNET, y solo activo algun servicio cuando es necesario.
Mira si van por ahi los tiros.