Es uno de los problemas del proyector, que no es compatible con todos los formatos 3D. Comprueba en esta página si la señal que le envías en SBS es una de las que permite:
http://pdf.crse.com/manuals/4290338221.pdf
(página 82 del manual)
Nota: tened en cuenta por ejemplo que la interpolación de imágenes en 3D solo se permite para las señales 1080p/24Hz. Personalmente he descartado este proyector porque tengo material 3D en otros formatos y me daría rabia no poder aprovecharlo