Sí, claro que puedes poner el proyector a 16:9, simplemente aparecerán bandas negras por abajo y por arriba, como en una tele 4:3. Para proyectar en la pantalla, lo suyo sería usar el zoom hasta que esas bandas negras queden fuera de la pantalla. Pero perderás algo de calidad, claro, ya que estarás usando parte de la resolución del proyector en proyectar bandas negras.

Saludos.