Pues para mí la mejor con diferencia es:

-Star Trek II, la ira de Khan. Pero de lejos...

Luego están bastante bien:

-Star Trek: primer contacto
-Star Trek VI: aquel pais desconocido

Estas serían las más recomendables. La primera película no te la recomiendo bajo riesgo de aburrimiento a no ser que seas fan de la serie original. Y eso que la película me parece buena, en serio.

Aparte:
-Star Trek: Nemesis, está entretenida, para los profanos creo que resulta de las mejores porque es en la que menos guiños hacen a la serie y demás... aunque lógicamente se disfruta más (como todas las pelis) conociendo la serie de tv, en este caso la nueva generación.

-La peor de todas con diferencia:Star Trek V. Un auténtico tostón, huye de ella.

-De todas maneras te recuerdo que el medio natural de Star Trek son las series, las películas hay que tomarlas como complemento a estas y no al revés.

Saludos.