Buenas,
yo la verdad es que llevo un tiempo algo liado y sin poder trastear los suficiente. Puse el servidor ftp y apenas lo he usado.

De todos modos mi experiencia con transmission para descargar torrents y con samba para copiar ficheros, me ha hecho comprobar que desde que fusioné las dos particiones HDD1 y HDD2 para dejar una única y de tipo ext3, noto un funcionamiento más estable.

Aún así, yo consideraría también el tipo de conexión. Si la conexión es wifi, en cuanto tengas algún problema de transmisión o de señal entre el router y el cacharro, se te va a cortar la transmisión.

Finalmente, otro de los casos en los que he notado que el T50 me da problemas es cuando lo cargo demasiado (ej. transmission + ftp + visualización de la TV con el TDT del T50). En la medida de lo posible procuro no simultanear, porque creo que el micro tampoco da para mucho más.

Siento no poder decirte mucho más, pero te animaría a probar con sistema de ficheros ext3 aunque sea un poco pesado el reformatear.

Un saludo,