Efectivamente muchas veces sacan versiones extendidas para vender más, pero en realidad no tienen metraje significativo en cantidad ni en relevancia (Black Hawk derribado por ejemplo). Pero claro, otras veces se aportan detalles que cuesta entender por qué se dejaron fuera (en Aliens la explicación de que Ripley tenía una hija es indispensable para entender el personaje) y en otras te cambia completamente la película (El reino de los cielos es una película totalmente distinta y muchísimo mejor, El Señor de los Anillos versión cines no es más que un resumen comercial).
En el caso de Tropic Thunder no he visto la versión de cines, pero la extendida lo que aporta es contenido que quitaron para hacerla más apta para el público: sangre y vísceras. No creo que la película cambie mucho, la verdad.