Los ajustes automáticos no es que sean malos, pero hay que saber interpretarlos.

Qué el Audyssey te dice que hay altavoces mal (invertidos)? Eso ocurre a menudo, si sabes que están bien conectados le dices que p'alante y listos!!
Qué te dice que la mejor frecuencia de corte del sub es 180? En eso es posible que tenga razón si detecta que los altavoces son muy pequeños y son incapaces de "bajar" bien en graves (la mayoría de altavoces satélites necesitan "cortar" alto)... mirando tus Boston veo que efectivamente es así, estos satélites no son mas que unos pequeños altavoces de medios-agudos realmente incapaces de reproducir bien frecuencias por debajo de 180Hz.

Creo que puedes confiar en los ajustes que te da Audyssey, para cualquier profano siempre es mucho mejor que ajustarlo a ojo (a oído).

El micro hay que colocarlo en un pequeño trípode, mirando hacia el techo y colocado justo en el sitio de escucha y a la altura de nuestros oídos.

Un saludo del Oso