Bueno pues ya está solucionado lo del disco externo, era un problema de formato, lo tenía configurado para Mac y tuve que cambiarlo a MS-DOS. Ahora lo reconoce perfectamente. Indagando por la web he visto gente que lo tenía conectado con discos de 1,5 TB así que ya sabemos que por capacidad de disco no será...
Ahora solo me queda probar mis mkv y si no noto saltos ni nada por el estilo estaré muy satisfecho con la compra