No sé qué tal irá el micro del Yamaha, el de Audyssey mide bastante lineal, según alguna comparativa que hay por ahí. Pero vamos, para hacerte una idea de cómo mide tu sistema en mi opinión te vale de sobra. Otra cosa sería si te fueras a fiar de esas medidas para aplicar EQ. Pero para ver más o menos la respuesta en frecuencia del sub en distintas ubicaciones o a distintos SPLs te vale perfectamente.
Luego necesitas un software, como el Smaartlive que te comenta atcing. Yo el que uso es el REW, que es gratuito y tiene un buen tutorial aquí (en inglés, eso sí):
http://www.hometheatershack.com/room...tml/index.html
http://www.hometheatershack.com/roomeq/
Y sí podrías usar la integrada del portátil. Si la salida de audio o la entrada de micro no son todo lo lineales que debieran, las medidas posiblemente no sean exactas, pero ya te digo que para hacerte una idea de cómo mide tu sistema y para ajustar el sub, en mi opinión te vale perfectamente.
Luego si te decides por la EQ paramétrica ya irás viendo lo que necesitas.
Saludos.