Michel como va a mejorar un MKV el contraste del BD que es la fuente de origen? eso es técnicamente imposible a no ser que se "remasterice" la fuente y aún así de donde no hay...
P.D. En cualquier caso la diferencia entre un MKV y un BD a favor del primero se daría en peliculas distintas y todo dependería de la edición de cada película en el formato BD que como digo es de donde parte el MKV.
P.D.2(Luis): Para evitar el judder el reproductor(dependerá del módelo) lo tendrás que configurar para que saque la señal a 1080p-24fps(23,976 Hz) y el proyector aceptarla y mostrarla tal cual o en un multiplo compatible (48, 96...)