El que tengas que configurar el reproductor en cada reinicio te está indicando que o bien el fichero que la guarda está corrupto o que es imposible escribir la nueva configuración. En sistemas de ficheros yaffs (al menos en algunos), pensados para memorias NAND, los ficheros borrados no se suelen sobrescribir, de esa forma todos los sectores son escritos más o menos las mismas veces y tardan más tiempo en aparecer los errores (por haber escrito el mismo sector muchísimas veces). También puede pasar que una vez llegados a un punto, no se pueda escribir un nuevo fichero salvo que se formatee de nuevo la partición completa.

La forma de solucionarlo es reinstalar el firmware por el método del botón (mantener el botón de encendido en el arranque durante unos segundos mientras tienes el firmware metido en un pendrive conectado a un puerto USB). De esa forma, si la flash no está dañada físicamente, se formateará de nuevo la partición donde se monta /usr/local/etc (la configuración se escribe en /usr/local/etc/dvdplayer).

Si te apetece probar, en vez de reinstalar el firmware podrías borrar los ficheros de /usr/local/etc/dvdplayer y reiniciar el reproductor para que los vuelva a crear, aunque eso no lo he probado e igual te da más problemas.

Lo de no poder desmontar la partición NTFS podría ser porque se estaba usando en ese momento. Cosa nada rara si tienes activa la opción de escanear los discos en busca de archivos multimedia nuevos (opción que, por otra parte, hace más probable la corrupción del disco). Yo lo probé en mi 3200 y no tuve problemas ni para desmontar la partición ni para que me arreglara los errores que encontró (que sí que encontró). Salvando las distancias, es como el chkdsk de DOS o versiones anteriores de Windows.

Saludos.