Shannon (el padre) sonriendo en prisión ya con su hijo "liberado", hay un breve momento en el que los ojos de Shannon brillan como los del crío. Y ahí me quedé pensando si era una pequeña concesión dramática, o si realmente hacía referencia a la herencia genética. Finalmente opté por esto segundo que me cuadraba más, pero me faltaba una pieza para completar el puzzle, y creo que esa pieza es justo lo que acabas de comentar, que el niño es un "adelantado" a su tiempo y por eso esa sociedad superior y futura, viene a buscarlo al pasado. O sea, que tendrías razón, y probablemente Shannon y su hijo, sean el origen de todo lo que vemos al final.