He trasteado poco con HDMI, en mi caso las elecciones son sencillas. Los fuentes 24p tienen que entrar como tal y salir a 60p, para que haga pull-down el Reon y no mi tele. Luego, mi DVD tiene que escalar a 1080, es requisito para que salga DVD-A y SACD por HDMI sin alteraciones. Todo esto fue my sencillo conseguir. Todavía no me he metido con las calibraciones, pero en principio no creo que va a hacer falta muchos ajustes.

Respecto a la segunda salida, nunca lo voy a usar y ni he leído esa parte del manual, me temo. Pero hay un hilo muy bueno sobre la configuración de los modelos 1007/3007/5007 en AVSForum, seguramente encuentras toda la información que necesitas allí.