Vaya, pues que raro, solo se me ocurre bajar la intensidad de luz del proyector (cerrar iris, bajar contraste, poner la lámpara en modo bajo consumo) siempre y cuando el proyector lo permita. O poner un filtro en la lente también puede valer.

Otra opción es dejar algo de luz encendida en la sala, se verá peor la imagen obviamente, pero al estar iluminada la sala es posible que se pueda mitigar algo el deslumbre porque los ojos de tus alumnos estarán más acostumbrados a la luz.