La calidad de sonido de un reproductor de CDs la da el DAC, así que si tu Marantz CD5400 te funciona sin problemas y solo quieres mejorar el sonido, deberías mejorar únicamente el DAC externo.
Personalmente yo no cambiaría nada si tienes intención de sustituir el ampli integrado en un futuro próximo. Los integrados modernos traen DACs integrados de buena calidad y permiten a la vez la lectura de ficheros digitales desde memorias externas o por red.
Yo tengo todo mi discografía digitalizada y guardada en en discos duros... la busco y manejo (like a mando a distancia) desde el móvil y no puede haber mas comodidad a la hora de escuchar música!!
Un saludo del Oso