Es más fácil que todo eso, y es justamente el motivo por el que uno piensa que es difícil, porque piensa en hacer las cosas de manera habitual y esta gente se ha montado un método "para torpes".
Si sincronizas las canciones significa que lo que ves en tu "Library" es lo que se pasará al iPod, de forma que si borras cosas, también las borras del iPod.
Lo que puedes hacer, en iPod / Opciones u Propiedades es decirle que no quieres sincronizar la librería de música con el iPod, de forma que una vez tienes cosas en la librería, seleccionas las que quieres pasar al iPod y las arrastras manualmente a éste, como si fuera el propio Windows.
El motivo por el cual no puedes arrastrar tú directamente las carpetas o canciones al disco duro del iPod sin ninhún software, es porque el iPod lleva una pequeña base de datos de lo que tiene y de las propiedades de cada archivo, de forma que puedes tener la misma canción en diferentes apartados sin repetir físicamente el espacio que ocupa.
Esto no se puede hacer sin esa pequeña base de datos, y que en el caso que nos ocupa, parece ser que es un fichero XML.
Quizás otros aparatos no tengan esa pequeña base de datos, pero me juego entonces lo que sea a que no serán instantáneos cuando vas a buscar algo, o la tardanza en arrancarlo será proporcional al número de ficheros que tiene dentro, pues deberá de leerse el disco y montar esa información en tiempo real.
El iPod es instantáneo, como si se tratara de un despertador. No hay que esperar nunca a nada, siempre está disponible.
Hay otros softwares que no son de Apple para manejar el cacharro. Yo no he probado ninguno porque por ahora me apaño de sobras con el iTunes. Creo que un tal "AnaPod" es la viva imagen del explorador de Windows.
Quizás lo que más critico yo del iTunes, es que está hecho en JAVA, y hace que sea leeeeento cuando se trabaja en un ordenador antiguo, cosa que no pasaría si se tratara de un compilado a código máquina.
Saludos.
( sigo sin ver el dibujo del candado, conecte el ipod fui al programa, abri todos los archivos, y no hay dibujo, ni exe, me estoy volviendo :>: :>: :>: . me podeis explicar lo de ejecutar en windows :? :? :? 
Y por 30 dolares mas tengo 10 gigas más...
