Una salida minijack ofrece dos canales de audio analógico independientes, a diferencia de los RCA que sólo tienen un canal por conector. Los canales para el subwoofer y el central son canales de audio analógico estándar al igual que el resto de canales así que no hay ninguna variación respecto a como conectarlos del PC al receptor.
Con un cable de minijack a RCA como los que utilizas, los conectores frontales y traseros son fáciles de identificar porque la asociación del canal izquierdo y derecho siempre se ha ligado a un color de los conectores RCA, pero no hay nada específico para los canales central y subwoofer.
Entonces sólo tienes que conectar al igual que con los otros canales un cable de minijack a RCA y poner los RCA indistintamente en las entradas del central y sub del receptor. ¿Que no suenan? Pues muy fácil, eso significa que están cruzados, así que intercambias los RCA entre el central y el sub en el receptor y ya está.
Vamos, que no hay ningún problema con esto.