Hay una opción que dice: "Mantener organizada la carpeta iTunes Music".

Lo más importante, si no quieres que te catalogue la música él, es decirle en qué carpeta quieres que te cree la biblioteca antes de que él empiece a tocarla porque entonces te lo organiza todo en la carpeta Mi Música\iTunes.

Una vez decidido en que carpeta quieres la biblioteca y con esa opción desactivada cada vez que metas un cd a la biblioteca lo cogerá de su carpeta raíz.

Así empecé yo.

El problema vendrá cuando utilices el iTunes para ripear un cd y te cree una carpeta igual que las que tienes y tengas que borrarlo de la biblioteca, cambiar el nombre de la carpeta, recolocarlo y volverlo a añadir.

A mí un día se me jodió el disco duro donde tenía la música. Al recuperarlo le dejé que organizara la carpeta automáticamente porque me di cuenta de que ya no iba a buscar la música al disco duro sino al iTunes.

Y sobre lo de "actualizar automáticamente el iPod" sólo tiene sentido desactivarlo si tu iPod es menor que el tamaño de tu biblioteca. Si tienes uno de 60 y una biblioteca de 40, lo ideal es dejarlo activado porque así no te pasará que un día vayas a buscar una canción al iPod y descubras que te has olvidado de pasarla.

iTunes es un pedazo de programa. A mí al principio también me entraron ganas de quemar a Steve Jobs. Ahora no sé qué haría sin él.
Sobretodo con la nueva versión, que te deja ver las carátulas de cd's organizados en la parte de arriba y que, además, añade la función de reproducción sin pausas.